Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms