Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms