Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MTA3Q9BTC8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms