Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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