Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2orf88Q9BSF0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms