Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM175Q9BSA9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM175Q9BSA9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms