Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MGME1Q9BQP7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGME1Q9BQP7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms