Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM7Q9BQ49 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms