Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF6Q99612 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF6Q99612 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms