Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms