Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SORT1Q99523 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms