Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED4Q96RK1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms