Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARXQ96QS3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARXQ96QS3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARXQ96QS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARXQ96QS3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARXQ96QS3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms