Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMG1Q96Q15 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms