Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms