Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM3Q96PE6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIM3Q96PE6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms