Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUNDC3BQ96NL0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms