Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP44Q96MT7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP44Q96MT7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms