Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP57Q96MR6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms