Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms