Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms