Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SENP8Q96LD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SENP8Q96LD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms