Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms