Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71F1Q96KD3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71F1Q96KD3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM71F1Q96KD3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM71F1Q96KD3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms