Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG1Q96JA1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRIG1Q96JA1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms