Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NSL1Q96IY1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSL1Q96IY1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms