Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAX2Q96IS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms