Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRELD1Q96HD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms