Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD1Q96GM5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms