Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms