Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHFRQ96EP1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHFRQ96EP1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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