Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC11Q96DB2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC11Q96DB2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms