Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUNDC1Q96C34 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUNDC1Q96C34 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUNDC1Q96C34 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms