Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTI1AQ96AJ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTI1AQ96AJ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms