Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC102AQ96A19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC102AQ96A19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms