Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMTQ93088 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms