Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDAQ92838 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDAQ92838 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDAQ92838 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EDAQ92838 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDAQ92838 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDAQ92838 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EDAQ92838 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDAQ92838 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDAQ92838 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDAQ92838 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDAQ92838 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EDAQ92838 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EDAQ92838 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EDAQ92838 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDAQ92838 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDAQ92838 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDAQ92838 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms