Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRAT1Q92837 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms