Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSPC1Q8WXF1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms