Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMO7Q8WWI1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMO7Q8WWI1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms