Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG1Q8WVM7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms