Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms