Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA4Q8NEY3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms