Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM3Q8NE01 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms