Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AVL9Q8NBF6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AVL9Q8NBF6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms