Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP38Q8NB14 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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