Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms