Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJD3Q8N144 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJD3Q8N144 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms