Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms