Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP2Q8IXW5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPAP2Q8IXW5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms